滇黄精转录组测序及类黄酮合成相关基因的分析

• 作者: 李春奇 秦昭 肖韵铮 韩世明
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 滇黄精 转录组 类黄酮 差异基因
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 931-940
• 页数: 10页
• 分类号: S147.2|S517
• 语种: 中文

摘要

为了丰富滇黄精不同器官发育的转录组数据,筛选参与类黄酮生物合成的关键基因,对滇黄精根、茎和叶进行转录组测序,并对参与类黄酮生物合成的差异基因进行筛选分析.转录组测序共获得219769条unigenes,平均长度502.31 bp,N50为627 bp.通过数据库(NR、eggNOG、Pfam、Swiss-Prot、KEGG、GO、KOG、COG)对uni-genes进行功能基因注释,分别有76179、67055、45508、35287、26259、39479、43295和24524条unigenes获得注释.基于转录组测序分析,筛选出10个与滇黄精类黄酮生物合成相关的差异基因,通过qRT-PCR检测差异基因在滇黄精不同器官中的表达水平,并与类黄酮含量进行相关性分析,确认CHI和CHS是滇黄精类黄酮生物合成途径中的关键基因,其基因的表达量决定了类黄酮的合成量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李春奇		28	190	8.0	12.0
2	韩世明		5	13	3.0	3.0
3	肖韵铮		1	0	0.0	0.0
4	秦昭		1	0	0.0	0.0