基于生物信息学研究IGFBP在肝癌中表达及其预后价值

• 作者: 张智勇 戴斌 王再兴 王德盛 金炜东 马丹丹
• 来源期刊: 中华肝脏外科手术学电子杂志
• 关键词: 癌,肝细胞 胰岛素样生长因子结合蛋白质类 预后 计算生物学
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 602-608
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.2095-3232.2020.06.022

摘要

目的 通过生物信息学分析探讨胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP)家族成员在肝细胞癌(肝癌)中表达情况和预后价值.方法 利用GEPIA在线分析IGFBP家族在肝癌中的基因表达,Kaplan-Meier生存曲线分析IGFBP与预后关系,采用cBioPortal for Cancer Genomics分析肝癌患者中IGFBP基因改变情况.采用GeneMANIA构建IGFBP相关基因作用网络,Metascape数据库基因网络进行基因本体(GO)富集分析.结果 GEPIA在线分析显示肝癌IGFBP3 mRNA相对表达量明显低于正常肝组织(P<0.05).IGFBP3表达与肿瘤病理分期有关(F=5.52,P<0.05).Kaplan-Meier生存分析显示,IGFBP3和IGFBP4 mRNA表达水平与不良预后密切相关(HR=1.50,0.43;P<0.05).cBioPortal分析显示肝癌中IGFBP发生基因改变,包括突变、融合、扩增、深缺失和多重改变,其中突变、扩增和深缺失是最常见改变.IGFBPs遗传改变0～1％.GeneMANIA分析确定了20个与IGFBPs密切相关的基因,GO富集分析发现IGFBP主要富集在与生长及细胞运动相关的信号通路中.结论 基于生物信息学研究发现IGFBP3在肝癌患者组织中表达异常,且与患者预后相关,IGFBP3可能作为肝癌预后生物标志物和治疗潜在靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴斌		1	0	0.0	0.0
2	王再兴		1	0	0.0	0.0
3	马丹丹		1	0	0.0	0.0
4	金炜东		1	0	0.0	0.0
5	张智勇		1	0	0.0	0.0
6	王德盛		1	0	0.0	0.0