基于生物信息学的肝细胞癌组织miR-1180表达与临床意义分析

• 作者: 丁佑铭 余斌 廖晓锋
• 来源期刊: 中国普通外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 癌,肝细胞 微RNAs 预后 计算生物学
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 862-869
• 页数: 8页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3978/j.issn.1005-6947.2018.07.010

摘要

目的:通过生物信息学数据分析探讨肝细胞癌(HCC)组织中miR-1180的表达及其临床意义.方法:下载GEO(Gene Expression Omnibus)和TCGA(The Cancer Genome Atlas)相关数据集,比较HCC组织和癌旁组织中miR-1180表达量,并分析miR-1180表达量与肝癌患者临床病理特征及预后之间的相关性.利用生物信息学方法对miR-1180的靶基因进行预测及功能富集分析,并结合预后分析结果筛选miR-1180关键靶基因.结果:miR-1180在HCC组织中较癌旁组织高表达,且对于HCC具有良好的诊断效能(AUC>0.8,均P<0.05);miR-1180的表达量与患者年龄、肿瘤家族史、肿瘤分化程度以及AFP等指标明显有关(均P<0.05).生存分析表明HCC组织中miR-1180高表达是影响HCC患者预后的独立危险因素(P<0.05).富集分析提示miR-1180的靶基因主要富集于脂质代谢、细胞迁移、转录调控等功能和脂肪酸降解等通路.PPARGC1A、ALDH2、SARDH、HMGCS2、ESR1、ETS2等为miR-1180关键靶基因,在HCC组织中均表达下调(均P<0.05),且相对低表达者预后较差(均P<0.05).结论:miR-1180在HCC组织中表达升高,其可能作为一种促癌miRNA参与HCC的发生、发展,并具有成为HCC诊断标志物、预后指标及治疗靶点的潜在应用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁佑铭	武汉大学人民医院肝胆腔镜外科	128	777	14.0	21.0
3	廖晓锋	湖北省襄阳市中心医院普通外科	11	52	4.0	7.0
4	余斌	武汉大学人民医院肝胆腔镜外科	8	13	2.0	3.0