肝细胞癌中差异表达的表达序列标签的生物信息学分析

• 作者: 朱武凌 李建生 段芳龄 薛乐勋 陈香宇 韩泽广
• 来源期刊: 郑州大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 表达序列标签 肝细胞癌
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 238-241
• 页数: 4页
• 分类号: R735.7
• 字数: 1982字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6825.2004.02.024

摘要

目的:采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌(HCC)中差异表达的表达序列标签(EST)的结构与功能,指导实验研究.方法:应用Blastn、SequencherTM、ORF Finder和DNASIS等软件分析肝细胞癌中差异表达的EST的全长、开放读码框、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能.结果:获得2条新的cDNA全长序列;2条EST分别定位于2p13～15、3p14;高表达EST主要表达于肿瘤组织,低表达EST主要表达于正常组织;高表达基因编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装,低表达基因编码蛋白质与机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关.结论:生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛乐勋	郑州大学细胞生物学研究室	140	1187	18.0	26.0
2	陈香宇	郑州大学消化疾病研究所	55	241	9.0	11.0
3	李建生	郑州大学第一附属医院消化内科	182	886	14.0	19.0
4	韩泽广		48	236	7.0	13.0
5	朱武凌	新乡医学院病理学教研室	30	176	5.0	12.0
6	段芳龄	郑州大学消化疾病研究所	62	234	8.0	11.0