基于生物信息学分析阿米巴痢疾基因表达谱的潜在生物靶标

• 作者: 刘鉴 张文飞
• 学科: 化学
• 关键词: 阿米巴痢疾 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 109-111
• 页数: 2页
• 分类号: R531.1
• 语种: 中文

摘要

基于溶组织内阿米巴感染后的基因表达谱（GSE23750），利用R语言、DAVID及STRING等生物信息学方法进行差异表达、功能富集及网络互作的分析。共获得207个差异基因，其中上调基因125个、下调基因82个。差异基因的功能主要是富集参与免疫反应的中性粒细胞活化、体液免疫应答、对细菌来源分子的反应等。最后通过cytoscape插件筛选出核心基因PTGS2、MMP1、MMP2、MMP10及SERPINE1。该分析将为阿米巴痢疾的治疗与预防提供新的靶点及研究思路。