茶树NAC基因的鉴定及其在逆境反应中的表达调控分析

• 作者: 刘国峰 周棋赢 彭波 梁萍 王仪佳 王艳丽 祝悦 穆逸雪 袁红雨 韩月华
• 来源期刊: 信阳师范学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 茶树 NAC转录因子 逆境反应 表达调控
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 基础理论研究
• 页码范围: 567-578
• 页数: 12页
• 分类号: Q601
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-0972.2020.04.010

摘要

利用隐马可夫模型检索和同源比对的方法,从茶树基因组鉴定出108个NAC成员(CsNAC).理化特征、进化关系、基因结构和保守基序分析表明,CsNAC蛋白长度在134～1950个氨基酸之间,分子量介于15.4～222 kD,等电点介于4.60～9.91,大部分为亲水性蛋白(除CsNAC97).其中,CsNAC3、8、14、23、32、74、82、90、106蛋白含跨膜结构域.进化分析将CsNAC家族分为18个亚类,ONAC022和NAP亚类成员最多,AtNAC3和OsNAC8亚类成员最少.CsNAC基因启动子区富含响应干旱、低温、盐胁迫以及病原菌侵染的序列元件.据转录组数据分析结果,CsNAC基因家族成员在不同组织和胁迫处理后呈现显著的表达差异.低温和干旱胁迫下的CsNAC共表达网络中,ABA参与调控其关键基因的表达;KEGG分析显示,信号传递、糖代谢、植物与病原菌互作等途径存在显著富集.