基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析

• 作者: 单春苗 吴家文 张声祥 施圆圆 赵历强 马克龙
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 细风轮 花青素 转录组 单基因 二氢黄酮醇还原酶
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 886-896
• 页数: 11页
• 分类号: Q949.777.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.06.011

摘要

为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128 856个Unigene.KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶.我们对其中的关键酶DFR(二氢黄酮醇还原酶)进行同源比对和空间结构模拟,结果显示DFR序列和结构均具有良好的保守性,且具有高度保守的NAD+结合位点,其二级结构主要由α螺旋和β折叠组成,在空间上α螺旋包裹着β折叠,形成“夹心饼干”样结构.