基于高通量测序和Q-PCR芯片技术分析养殖环境中苍蝇携带细菌菌群结构和耐药基因特点

• 作者: 周玉法 崔娜 张红娜 翟真真
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苍蝇 动物粪便 高通量测序 Q-PCR 细菌菌群 耐药基因 移动遗传元件
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 70-79
• 页数: 10页
• 分类号: Q78
• 语种: 中文

摘要

利用高通量测序和定量聚合酶链反应芯片技术,分析和比较鸡舍和奶牛舍粪便和苍蝇细菌菌群结构、潜在致病菌以及耐药基因(Antibiotic resistance gene,ARG)和移动遗传元件(Mobile genetic element,MGE).动物粪便和苍蝇样品中鉴定出13个共有细菌门,且优势菌门一致,分别为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria).另外,从苍蝇和粪便样品中分别检测到32和21个潜在致病菌属,其中9个为两者共有;从苍蝇和粪便中分别扩增出242和273个ARG/MGE,其中215个为两者共有.溯源分析显示,苍蝇携带菌群结构、ARG和MGE均与其所处环境动物粪便相似性较高.养殖环境是苍蝇携带细菌菌群和耐药基因重要来源,苍蝇可作为分析养殖环境中耐药基因特点重要参考.