赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析

• 作者: 兰进 徐晓兰 朱风丽 石林春 陈体强 陈向东 陈士林 陈虎
• 来源期刊: 世界中医药
• 学科: 医学
• 关键词: 赤芝 基因组 SSR标记 多态性 种质资源 遗传多样性 聚类分析 育种
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 专题——中药资源与本草基因组学
• 页码范围: 677-682
• 页数: 6页
• 分类号: R284
• 字数: 3808字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2020.05.004

摘要

目的:基于赤芝全基因组序列开发SSR标记,研究其种质资源遗传多样性,为赤芝种质资源品种鉴定和分子育种提供理论基础.方法:利用60对SSR引物,对26份不同来源的赤芝菌株进行扩增以筛选出具有多态性的位点;采用毛细管电泳对其进行基因分型,并分析菌株间的遗传多样性.结果:60对引物中,筛选出24个有多态性条带的SSR位点.共扩增出269个多态性条带,平均每个SSR位点增出11.20个多态性条带;检测出150个等位基因,平均检测出6.23种基因型;各引物的多态信息含量(PIC)为0.57～0.91,平均为0.81;遗传一致性和遗传距离变异范围分别为0.28～0.95和0.06～0.73;聚类分析结果分析可以很好的反映出各个菌株间的亲缘关系,在遗传距离系数0.17处可分为4大类,部分来自同一地区的菌株材料分散于各个分支,未体现明显地域性,说明菌株的遗传背景复杂,多态性高.结论:筛选出的24个赤芝SSR位点,可以用于赤芝菌株资源遗传多样性分析,为赤芝优良品种的引种及选育提供理论基础.