澳洲坚果MiMYB2基因克隆及结构与功能分析

• 作者: 樊松乐 汤秀华 王文林 王立丰 覃振师 许鹏 谭秋锦 贺鹏 郑树芳 陈海生 黄锡云
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 澳洲坚果 MiMYB2 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 913-922
• 页数: 10页
• 分类号: S664.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.06.014

摘要

为研究R2R3-MYB转录因子家族成员在澳洲坚果生长发育和产量形成中的作用机制,利用PCR技术从澳洲坚果品种“桂热一号”叶片中克隆MiMYB2基因并采用生物信息学对其结构及功能进行分析.结果 表明,克隆获得的MiMYB2(NCBI登录号:MN254976)基因cDNA序列全长1 210 bp,开放阅读框(ORF)1 002 bp,编码333个氨基酸.MiMYB2编码一个无跨膜结构、无信号肽且定位于细胞核的不稳定亲水蛋白,含两个SANT保守结构域,属于R2R3-MYB家族.BLAST分析发现MiMYB2与荷花NnMYB3-1ike氨基酸序列同源性最高.系统进化分析将MiMYB2与AtMYB17、AtMYB106和AtMYB16聚类为S9亚族.通过转录组数据分析MiMYB2基因在“桂热一号”和“695”品种澳洲坚果枝条、花和叶片中的表达模式,表明MiMYB2在“桂热一号”品种花中的表达量最低,“695”品种花中的表达量最高.推测MiMYB2与澳洲坚果花生长发育密切相关.本研究为阐明MiMYB2基因在澳洲坚果生长发育和产量形成中的作用机制提供理论参考.