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深龋微生物碳水化合物活性酶的特征性研究
深龋微生物碳水化合物活性酶的特征性研究
作者:
于然
刘高霞
周密
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
深龋
微生物群落
宏基因组
碳水化合物活性酶
摘要:
目的:了解深龋微生物碳水化合物活性酶特征.方法:收集第一恒磨牙深龋浅层和深层样本共16份,提取DNA后基因组高通量测序.测序结果比对NCBI nr及CAZy数据库,分析深龋微生物组成及碳水化合物活性酶特点.结果:深龋微生物在CAZy库中注释的酶家族主要为糖苷水解酶(47.28%),其次为糖基转移酶(35.37%),辅助氧化还原酶最少(0.38%).相对丰度前10的活性酶主要集中在GH13和GH1家族.拟杆菌门包含相对比例最多的活性酶基因,且深龋浅层和深层微生物碳水化合物活性酶模式无明显差异(P>0.05).结论:深龋浅层及深层微生物碳水化合物活性酶特征相似,基因组的酶谱分布提示其代谢蔗糖和淀粉类植物源性碳水化合物有遗传优势.拟杆菌门具有更广泛的碳水化合物底物.
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文献信息
篇名
深龋微生物碳水化合物活性酶的特征性研究
来源期刊
临床口腔医学杂志
学科
医学
关键词
深龋
微生物群落
宏基因组
碳水化合物活性酶
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
387-390
页数
4页
分类号
R781.1
字数
4104字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1003-1634.2020.07.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
周密
华中科技大学同济医学院附属协和医院口腔医学中心
6
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3.0
7
于然
华中科技大学同济医学院附属协和医院口腔医学中心
2
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微生物群落
宏基因组
碳水化合物活性酶
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床口腔医学杂志
主办单位:
华中科技大学同济医学院附属同济医院
中华口腔医学会口腔黏膜病专业委员会
中华医学会武汉分会
出版周期:
月刊
ISSN:
1003-1634
CN:
42-1182/R
开本:
大16开
出版地:
湖北省武汉市解放大道1095号同济医院内
邮发代号:
38-117
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
6820
总下载数(次)
15
总被引数(次)
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