森林草莓FvZF-HD7基因的鉴定及表达分析

• 作者: 刘敏 名川信吾
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 森林草莓 生物信息学 FvZF-HD7 亚细胞定位 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 19-27
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 5200字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2020.01.0019

摘要

锌指同源蛋白ZF-HD(zinc finger homeodomain)家族是植物中所特有的一类转录因子家族,在响应植物逆境胁迫,调控花发育以及种子寿命等方面具有重要作用,但其在草莓中的功能尚不清楚.该研究从森林草莓(Eragaria vesca)基因组数据库分离获得了10个ZF-HD家族的基因.进化树分析显示,按照亲缘关系远近该基因家族可分为6个不同的亚族;启动子顺式元件分析发现,该基因家族基因的启动子区域含有较多的逆境胁迫和激素响应相关的元件.荧光定量PCR检测发现,FvZF-HD7基因在花中的表达量显著大于其他基因;组织特异性表达分析表明,FvZF-HD7基因在花中表达量最高,在叶和茎中也有表达,在果实发育的前期表达量较高,而在果实发育后期急剧降低.利用森林草莓‘Yellow Wonder 5AF7'(YW)的cDNA成功克隆到FvZF-HD7基因,生物学信息学分析表明FvZF-HD7基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸;序列比对结果显示,其编码的蛋白质同时含有ZF以及HD保守结构域;蛋白质的相对分子质量为39 153.89 Da,结构中富含a螺旋和无规则卷曲.成功构建表达载体pGWB5-FvZF-HD7,将目的基因载体转入烟草中,Confocal激光共聚焦显微镜观察发现,转基因烟草的细胞核中检测到GFP信号,表明FvZF-HD7蛋白定位于细胞核中.研究表明,FvZF-HD7可能广泛参与了植物花发育和逆境胁迫调控,为进一步分析森林草莓ZF-HD基因家族的功能奠定了理论与分子基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘敏	福建农林大学园艺学院	9	69	4.0	8.0
5	名川信吾	福建农林大学海峡联合研究院园艺植物生物学及代谢组学研究中心	1	0	0.0	0.0