近交陆川猪的遗传稳定性研究

• 作者: 吴华莉 张莺莺 曹建国 涂尾龙 王洪洋 谈永松
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆川猪 连续性纯合片段 基因组纯合度 生产性状
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1795-1803
• 页数: 9页
• 分类号: S828.2
• 字数: 5713字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.08.003

摘要

旨在探讨高度近交陆川猪的遗传稳定性.本试验采集20头近交和6头非近交陆川猪的耳组织样品进行个体基因组重测序,通过扫描全基因组SNPs分析近交陆川猪群体的遗传多样性,并基于基因组纯合度挖掘近交陆川猪群体中特异的纯合区域(region of homozygosity,ROHs)及相关基因.结果表明,近交陆川猪群体的观察杂合度(0.373)小于期望杂合度(0.491),推测其发生了选择或者近交;系统进化树和群体遗传结构分析发现,近交陆川猪群体在近交过程中分化成为两个近交家系,且230、236、239、132、130及126号个体亲缘关系最近;在近交群体中,基因组纯合度和基因组长纯合片段比例的均值分别为59.64％ 和0.12,都极显著高于非近交群体53.18％ 和0.05(P<0.01),说明该近交陆川猪群体已达到高度近交;近交群体和非近交群体中分别有1250和633个RO H s,重叠分析结果显示,特异存在于近交群体中的阳性纯合区域(positive region of homozygosity,pROHs)有224个,其中由于近交产生的纯合突变可能影响参与激素合成过程、胰液分泌、膜脂代谢过程、Ig A产生的肠道免疫网络及纹肌细胞分化等相关的1322个基因.结果提示,近交陆川猪群体的遗传多样性低、基因组纯合度高且已达到高度近交,说明该群体的遗传稳定性高.此外,近交陆川猪群体在近交过程中产生的纯合突变可能与机体的免疫、生长等生产性状相关.