涉案偶蹄目动物DNA条形码构建

• 作者: 何建 侯森林 刘大伟 周用武 费宜玲
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 偶蹄目 DNA条形码 物种鉴定 COI Cyt b 基因片段
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 专题报道
• 页码范围: 27-32
• 页数: 6页
• 分类号: Q34|S718.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.202004013

摘要

[目的]利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考.[方法]对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树.[结果]在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64％～99.82％,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种.其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高.对于COI片段,种内遗传距离为0～1.4％,种间遗传距离为1.8％～18.8％.对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0～0.5％,种间遗传距离为4.0％～15.8％.两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔.COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支.[结论]基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定.在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险.