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南京林业大学学报(自然科学版)期刊
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涉案偶蹄目动物DNA条形码构建
涉案偶蹄目动物DNA条形码构建
作者:
何建
侯森林
刘大伟
周用武
费宜玲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
偶蹄目
DNA条形码
物种鉴定
COI
Cyt b
基因片段
摘要:
[目的]利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考.[方法]对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树.[结果]在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种.其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高.对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%.对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%.两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔.COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支.[结论]基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定.在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险.
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篇名
涉案偶蹄目动物DNA条形码构建
来源期刊
南京林业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
偶蹄目
DNA条形码
物种鉴定
COI
Cyt b
基因片段
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
专题报道
研究方向
页码范围
27-32
页数
6页
分类号
Q34|S718.6
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2006.202004013
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
主办单位:
南京林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2006
CN:
32-1161/S
开本:
大16开
出版地:
南京市龙蟠路159号南京林业大学
邮发代号:
28-16
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
4299
总下载数(次)
8
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