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摘要:
[目的]利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考.[方法]对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树.[结果]在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种.其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高.对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%.对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%.两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔.COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支.[结论]基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定.在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险.
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文献信息
篇名 涉案偶蹄目动物DNA条形码构建
来源期刊 南京林业大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 偶蹄目 DNA条形码 物种鉴定 COI Cyt b 基因片段
年,卷(期) 2020,(6) 所属期刊栏目 专题报道
研究方向 页码范围 27-32
页数 6页 分类号 Q34|S718.6
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-2006.202004013
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南京林业大学学报(自然科学版)
双月刊
1000-2006
32-1161/S
大16开
南京市龙蟠路159号南京林业大学
28-16
1958
chi
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