斑马鱼cetp基因敲除模型的建立及其肝脏转录组学分析

• 作者: 任景怡 冯冬萍 商汉桥 屠强 张停 张虎军 杨梦溪 杨航
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 胆固醇酯转运蛋白 动脉粥样硬化性心血管疾病 CRISPR/Cas9系统 斑马鱼 转录组测序
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 940-947
• 页数: 8页
• 分类号: R541.4
• 字数: 4753字
• 语种: 中文

摘要

目的 建立斑马鱼cetp基因敲除模型,探讨cetp基因敲除后在动脉粥样硬化中的转录组学变化.方法 采用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除斑马鱼cetp基因,构建cetp-/-斑马鱼模型.采用转录组测序观察cetp基因敲除后基因表达谱变化,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对差异表达基因进行功能富集分析.结果 采用CRISPR/Cas9技术敲除斑马鱼cetp基因,斑马鱼产生增加5个碱基的移码突变.转录组测序发现,cetp-/-斑马鱼肝脏基因表达谱发生显著变化,共筛选到3808个发生显著变化的基因(P<0.05),其中显著上调基因有1918个,显著下调基因1890个.脂质代谢相关基因如abca1、abcg2a基因显著上调,lipg显著下调;与自噬相关信号通路基因如atg13显著上调;下调基因富集到DNA及RNA合成、三羧酸循环等相关通路.结论 建立了斑马鱼cetp-/-模型,可用于胆固醇酯转运蛋白(CETP)在动脉粥样硬化疾病中作用机制的研究.尽管抑制CETP可使高密度脂蛋白胆固醇升高而抑制动脉粥样硬化,但是斑马鱼cetp敲除后激活机体炎性反应而促进动脉粥样硬化,提示CETP在动脉粥样硬化发生发展的过程中具有双重调节作用.