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摘要:
SQUA启动子结合蛋白-box(SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box,SBP-box)基因家族编码一类植物特有的SBP转录因子,在植物界分布广泛,参与植物生长、发育、繁衍等多方面调控,包括胚胎发生、次生产物合成、胁迫应答等,在作物改良方面具有价值.本研究主要通过生物信息学以及实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法,对高粱(Sorghum bicolor)SbSBP15基因进行克隆和表达分析.研究结果显示,该基因CDS全长1227 bp(GenBank No.MT634207),编码408个氨基酸.SbSBP15蛋白含有1个典型SBP结构域,相对分子质量为42.19 kD,等电点为8.87;与玉米(Zea mays)相应的同源基因亲缘关系最近;亚细胞定位主要在细胞核;具较强的亲水性;蛋白互作网络分析表明,SbSBP15可与蛋白激酶相互作用.qRT-PCR分析表明,SbSBP15在高粱茎中表达量最高,受干旱和盐胁迫诱导表达;植物激素吲哚乙酸(indole-3-acetic acid,IAA)处理后其表达上调,而水杨酸(salicylic acid,SA)则抑制其表达.SbSBP15蛋白在大肠杆菌(Escherichia coli)Rosetta(DE3)菌株的原核表达结果显示,0.8 mmol/L异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)于25℃诱导的表达量最高.本研究可为高粱分子遗传研究提供候选基因,为植物SBP15基因的生物学功能研究提供基础资料.
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文献信息
篇名 高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析
来源期刊 农业生物技术学报 学科 农学
关键词 高粱 SbSBP15 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
年,卷(期) 2020,(9) 所属期刊栏目 研究论文与报告
研究方向 页码范围 1554-1566
页数 13页 分类号 S184
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.09.004
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高粱
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基因克隆
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农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
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