沙特番茄黄化曲叶病毒AC2基因编码蛋白的生物信息学分析

• 作者: 冯悦 朱晓林 王宝强 赵耀东 魏小红
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 沙特番茄黄化曲叶病毒 AC2基因 转录激活蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 生理与分子生物学
• 页码范围: 1773-1780
• 页数: 8页
• 分类号: Q943
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201903058

摘要

该试验旨在通过生物信息学方法分析沙特番茄黄化曲叶病毒AC2基因编码的转录激活蛋白TrAP(transcriptional activator protein)的结构及功能.该文通过在线软件预测和分析了番茄中AC2基因编码蛋白的一级结构、二级结构、磷酸位点、糖基位点、三级结构及其重要的功能;通过最大似然法对不同物种AC2基因编码蛋白序列构建系统发育树,进行系统发育分析.结果表明:番茄中AC2基因共编码135个氨基酸,且编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白质;二级结构以无规则卷曲折叠为主,比例为58.52％;该蛋白不存在跨膜结构域,属非跨膜蛋白且不存在信号肽;该蛋白1～129个氨基酸区域为双生病毒超基因家族(Gemini_AL2 superfamily)结构域;系统进化情况和植物分类学基本一致,沙特番茄双生病毒AC2基因与南非木薯间的亲缘关系最近.该基因编码蛋白结构与功能的分析为进一步研究AC2双生病毒基因家族奠定了基础,同时为番茄抗病在病虫害防治方面提供一种可行的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏小红		55	884	15.0	29.0
2	朱晓林		4	0	0.0	0.0
3	王宝强		7	8	2.0	2.0
4	冯悦		2	0	0.0	0.0
5	赵耀东		2	0	0.0	0.0