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不同月份沙棘根瘤细菌群落结构特征的分析对比
不同月份沙棘根瘤细菌群落结构特征的分析对比
作者:
刘西平
张情
张明明
张春丽
樊梦颖
原文服务方:
西北林学院学报
沙棘
根瘤
高通量测序
弗兰克氏菌
细菌群落结构
摘要:
为深入了解沙棘(Hippophae rhamnoides)根瘤细菌的多样性及其随时间变化,采用高通量测序技术对中国沙棘(H.rhamnoides subsp.sinensis)4个不同月份根瘤细菌群落结构特征进行了分析对比.结果表明,在根瘤瘤瓣刚刚开始萌发的3月,沙棘根瘤细菌的多样性和丰富度显著高于5、7月和8月.4个采样时间所获得的根瘤细菌可归类为21门36纲75目145科234属,其中有8菌门的17菌纲在不同采样时间一直存在.从相对丰度来看,放线菌门放线菌纲(Acti-nobacteria)始终为优势菌纲,其相对丰度3月为65.30%,5、7月和8月均超过96.05%;同时,根瘤细菌中还存在变形菌门的α-、β-和γ-变形菌纲(Alpha-,Beta-,Gammaproteobacteria)以及拟杆菌门噬纤维菌纲(Cytophagia)和鞘脂杆菌纲(Sphingobacteriia)等多种类型的非放线菌.弗兰克氏菌目(Frankiales)细菌在整体根瘤细菌群落中的相对丰度3月为48.60%,显著低于5月的93.54%、7月的95.48%和8月的94.73%;4个采样时间共获得5科6属10条可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),其中弗兰克氏菌科(Frankiaceae)弗兰克氏菌属(Frankia)的OTU235占该目的相对丰度在不同时间均在99%.表明沙棘根瘤细菌群落在不同月份均是极其丰富和多样的,其中既有多种类型的放线菌也有多种类型的非放线菌,但均以弗兰克氏菌科弗兰克氏菌属细菌占绝对优势;同时,根瘤细菌群落结构(特别是弗兰克氏菌的相对丰度)随季节发生着显著变化.
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篇名
不同月份沙棘根瘤细菌群落结构特征的分析对比
来源期刊
西北林学院学报
学科
关键词
沙棘
根瘤
高通量测序
弗兰克氏菌
细菌群落结构
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
森林保护学
研究方向
页码范围
160-167
页数
8页
分类号
S763.13
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-7461.2020.06.23
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
西北林学院学报
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-7461
CN:
61-1202/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1984-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5683
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总被引数(次)
73559
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