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河南省4株新型冠状病毒的分离和病原特征分析
河南省4株新型冠状病毒的分离和病原特征分析
作者:
卢世栋
叶莹
李东晓
李幸乐
毋碧聪
胡晓
郭万申
黄学勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
严重急性呼吸综合征冠状病毒2型
新型冠状病毒肺炎
全基因测序
进化分析
摘要:
目的 分离新型冠状病毒毒株,分析新型冠状病毒基本生物学特征和遗传进化特征.方法 筛选具有代表性的新型冠状病毒核酸阳性样本,采用Vero和Vero-E6细胞系分离病毒、荧光定量RT-PCR方法初步鉴定,MiSeq测序技术获取新型冠状病毒全基因组序列,开展进化分析.结果 4个新型冠状病毒核酸阳性的咽拭子样本在Vero和Vero E6细胞均产生细胞病变,细胞病变可以稳定传代.荧光定量RT-PCR鉴定四株病毒二代培养物均显示为新型冠状病毒核酸阳性;三株病毒二代培养物经Miseq测序获得新型冠状病毒全基因组序列,一株病毒二代培养物获得部分新型冠状病毒基因组序列.全基因序列比较显示三株新型冠状病毒均与武汉分离株Wuhan-Hu-1和WIV04亲缘关系最为接近,HN01与Wuhan-Hu-1株的NS3蛋白存在一个氨基酸差异,HN02与Wuhan-Hu-1株的NS8蛋白存在一个氨基酸差异,HN04与Wuhan-Hu-1株在同源编码区核苷酸同源性为100%.结论 河南省新型冠状病毒株与湖北武汉株高度同源,暂未发现有意义的新型冠状病毒变异株.
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文献信息
篇名
河南省4株新型冠状病毒的分离和病原特征分析
来源期刊
河南预防医学杂志
学科
医学
关键词
严重急性呼吸综合征冠状病毒2型
新型冠状病毒肺炎
全基因测序
进化分析
年,卷(期)
2020,(11)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
801-804
页数
4页
分类号
R446
字数
语种
中文
DOI
10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2020.11.001
五维指标
作者信息
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李东晓
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胡晓
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郭万申
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李幸乐
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2型
新型冠状病毒肺炎
全基因测序
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期刊影响力
河南预防医学杂志
主办单位:
河南省预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1006-8414
CN:
41-1220/R
开本:
大16开
出版地:
郑州市郑东新区农业南路105号
邮发代号:
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
6155
总下载数(次)
8
总被引数(次)
12025
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