罗伊氏乳杆菌对仔猪空肠miRNAs表达谱的影响

• 作者: 兰云贤 孙倩 杨飞云 王琪 王瑞生 黄金秀 齐仁立
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 罗伊氏乳杆菌 miRNA Solexa高通量测序 空肠 仔猪
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 营养与饲料
• 页码范围: 2156-2164
• 页数: 9页
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.09.013

摘要

试验旨在研究罗伊氏乳杆菌对仔猪空肠miRNAs表达的影响.选用1日龄健康约克×荣昌仔猪6窝,随机分为两组,每组3窝(共27头).即对照组(每天每头灌喂0.1％的无菌蛋白胨溶液),LR组(每天每头灌喂活菌总数为1.0×1010CFU的罗伊氏乳杆菌),分别在10和20日龄,每组选取6头进行屠宰,采集空肠样品.通过Sol-exa高通量测序技术检测空肠miRNA的表达谱,利用生物信息学技术进行靶基因预测和功能分析.结果 显示:1)试验构建了8个文库,共获得187 103 840条纯净reads序列,其中22 nt长度序列占的比例最大;2)10和20日龄分别鉴定出354和352个已知的miRNAs,其中有329个miRNAs共表达;3)灌喂罗伊氏乳杆菌组仔猪空肠miRNA差异表达,10和20日龄分别获得7和9个差异显著的miRNAs,ssc-miR 218在两个日龄中都差异表达;4)对差异表达的miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路分析,发现有10 221个靶基因富集到293条通路上,有66条通路显著富集(P＜0.05),包括与肠道发育及免疫调控相关的MAPK和PI3K-Akt信号通路;5)随机挑选6个差异表达miRNAs进行荧光定量PCR验证,验证结果与测序结果基本一致.本研究表明,罗伊氏乳杆菌可能通过影响空肠miRNAs表达来调控有关肠道健康的信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨飞云		60	396	10.0	17.0
2	王瑞生		50	135	7.0	10.0
3	王琪		11	17	3.0	3.0
4	齐仁立		13	82	5.0	9.0
5	黄金秀		34	140	6.0	10.0
6	兰云贤		3	0	0.0	0.0
7	孙倩		2	0	0.0	0.0