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长白山野杂猪和东北民猪背最长肌的mRNA转录组比较分析
长白山野杂猪和东北民猪背最长肌的mRNA转录组比较分析
作者:
关立增
娄安钢
季久秀
李钟淑
金太花
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
长白山野杂猪
东北民猪
背最长肌
mRNA
摘要:
本研究通过RNA-seq技术对3个长白山野杂猪与3个东北民猪背最长肌样本进行了mRNA测序和差异分析,从而为筛选长白山野杂猪肉质性状功能基因奠定基础.结果 显示:在长白山野杂猪与东北民猪中均有100%以上的序列能完全比对到猪的基因组上,而所转录的基因占总基因的比例在3头长白山野杂猪中平均为59.67%,3头东北民猪为58.73%,而在不同个体间SNP位点数为14299~19671;在2个品种猪背最长肌中共表达基因有15842个,仅在长白山野杂猪中表达的基因有619个,仅在东北民猪中表达的基因有710个;在2个品种猪背最长肌中共获得显著差异表达的基因153个,其中在长白山野杂猪中上调表达的基因有55个,下调表达的基因有98个;GO分析显示,153个差异表达基因被注释到33条GO条目中,其中11条被注释到生物学过程中,11条被注释到细胞组分,11条被注释到分子功能;KEGG分析显示,这些差异表达基因被富集到130条通路中,其中主要与脂肪代谢相关的信号通路有关.结果 表明,长白山野杂猪与东北民猪背最长肌中mRNA表达存在差异,这些差异表达基因将是将来研究2个品种猪间肉质差异的主要靶标之一.
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脂肪酸
氨基酸
肌小节
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
长白山野杂猪和东北民猪背最长肌的mRNA转录组比较分析
来源期刊
中国畜牧杂志
学科
农学
关键词
长白山野杂猪
东北民猪
背最长肌
mRNA
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
遗传育种
研究方向
页码范围
61-66
页数
6页
分类号
S828.2
字数
语种
中文
DOI
10.19556/j.0258-7033.20190805-06
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
李钟淑
98
259
7.0
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娄安钢
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3
金太花
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关立增
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季久秀
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长白山野杂猪
东北民猪
背最长肌
mRNA
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国畜牧杂志
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0258-7033
CN:
11-2083/S
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号院56号楼1层101、102
邮发代号:
82-147
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
8492
总下载数(次)
10
总被引数(次)
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中国畜牧杂志1998
中国畜牧杂志2020年第9期
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中国畜牧杂志2020年第12期
中国畜牧杂志2020年第11期
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