基于RNA-seq的db/db小鼠大脑皮质的转录组学分析

• 作者: 刘萌萌 杨彩红 白涛 章毅 范彦英 郭宝璐 郭杰
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 转录组测序 2型糖尿病 大脑皮质 脑功能障碍
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 16-23
• 页数: 8页
• 分类号: R36
• 字数: 2439字
• 语种: 中文

摘要

目的 通过对db/db和野生型(WT)小鼠大脑皮质组织全转录组学分析,探索参与调节2型糖尿病诱导的脑功能障碍的差异表达基因(DEGs)及相关通路和网络.方法 取雄性野生型WT和db/db小鼠各9只,在第8和24周检测小鼠的体质量和血糖,之后收集动物大脑皮质进行全转录组测序(RNA-seq),并进行DEGs,GO、KEGG及蛋白互作网络分析.结果 与WT组相比,db/db组大脑皮质发生变化的306个转录本中有178个表达上调,128个表达下调.DEGs中,43个上调(如Clcnka和Trim17),59个下调(如Arih1和Nectin-3).蛋白互作网络图中的13个枢纽基因均下调,且大多属于线粒体编码家族.同时,db/db小鼠在多项GO富集类别中具有显著差异,如细胞过程、细胞部分等.此外,KEGG功能富集结果显示DEGs在代谢、帕金森病(PD)、阿尔茨海默病(AD)等相关通路中高度富集,且这些富集通路中的DEGs主要影响了线粒体氧化磷酸化过程.结论 揭示了2型糖尿病与中枢神经系统损伤之间的关系及潜在的相关基因、通路及网络.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨彩红	山西医科大学基础医学院药理教研室	26	88	5.0	7.0
2	白涛	山西医科大学基础医学院药理教研室	17	35	4.0	4.0
3	刘萌萌	山西医科大学基础医学院药理教研室	7	17	3.0	4.0
4	章毅	山西医科大学基础医学院药理教研室	26	78	5.0	7.0
5	郭宝璐	山西医科大学基础医学院药理教研室	3	7	2.0	2.0
6	郭杰	山西医科大学基础医学院药理教研室	1	0	0.0	0.0