胆汁酸诱导的细粒棘球绦虫分化基因的转录组学分析

• 作者: 代雨岑 吴军 宗李红 张文宝 李军 杨梅 王甜
• 来源期刊: 职业与健康
• 学科: 医学
• 关键词: 细粒棘球绦虫 胆汁酸 转录组 差异表达基因 GO功能分类
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 实验·监测与检验
• 页码范围: 1316-1323
• 页数: 8页
• 分类号: R113
• 语种: 中文

摘要

目的 探究细粒棘球绦虫(E.g)原头蚴向成虫早期发育的分子机制以及成虫体外培养时犬胆汁的作用,与平行无犬胆汁的包囊方向培养的样本相比较,发现成虫早期发育的差异表达基因.方法 通过对有无犬胆汁培养的E.g原头蚴发育早期的21个样本进行转录组测序;对测序得到的原始序列(raw reads)经过质控(QC)检测,再与参考序列比对;进行比对率和序列在参考序列上分布的统计来判断结果是否适合进一步分析.若通过,则进行差异表达基因(DEG)筛选,对筛选出的组间差异表达基因,进行基因本体(GO)功能分析.结果 DEG显示,在有无0.05％犬胆汁平行培养相同时间的两组样本中,AW0.5h-vs-AWB0.5h.DEseq2检测中,上调的DEG数目为65个,下调的DEG数目为9个;而AW3h-vs-AWB3h.DEseq2和AW72h-vs-AWB72h.DEseq2两组差异检测中,上调的DEG数目均为0个,下调的DEG数目分别为0和1个.AW0.5h-vs-AWB0.5h.DEG GO功能分析显示在细胞组分中,表达产物位于膜.除膜部分的差异基因表达有下调以外,其余细胞组分中的差异基因都上调,而且表达产物位于膜的差异基因数目最多,为5个,其中基因EgrG_000127200和EgrG_000328500下调,基因EgrG_000501300、EgrG_001127500和EgrG_000827500上调.结论 基因EgrG_000501300、EgrG_001127500和EgrG_000827500可能为研制犬抗细粒棘球绦虫感染疫苗及药物提供候选基因.