基于神威众核处理器的排列熵算法并行加速方法

• 作者: 于建志 冯鲁彬 张浩 梁建国 花嵘
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 排列熵 神威众核处理器 MPI OpenACC 嵌入维数
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 2022-2026
• 页数: 5页
• 分类号: TP301.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.19734/j.issn.1001-3695.2019.01.0005

摘要

随着嵌入维数的增大,排列熵(permutation entropy,PE)算法的运算规模将会成倍增加,对计算的时效性提出了更高的要求.针对国际上首台计算性能超过100P的神威·太湖之光异构众核超级计算机,提出一种针对排列熵算法移植和并行化方法,核组之间基于MPI对相空间矩阵进行数据划分,核组内部基于OpenACC实现划分区域内部并行;然后针对SW26010众核处理器结构特征,调整减少主从核通信次数和消除原子操作,将排列熵算法成功移植并加速;最后通过大坝振荡数据进行测试.测试结果表明,该方法能够很好地发挥SW26010众核处理器加速优势,单核组性能较主核版本最高可获得7.18倍加速,同时在神威·太湖之光大规模集群上进行强可扩展性分析,128核组时最高实现了85.6倍的性能提升.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	花嵘	山东科技大学计算机科学与工程学院	38	91	4.0	8.0
2	张浩	山东科技大学计算机科学与工程学院	10	18	2.0	4.0
3	梁建国	山东科技大学计算机科学与工程学院	3	1	1.0	1.0
4	于建志	山东科技大学计算机科学与工程学院	4	3	1.0	1.0
5	冯鲁彬	山东科技大学计算机科学与工程学院	1	0	0.0	0.0