基于分子对接技术虚拟筛选天然产物抗MRSA活性成分

• 作者: 雷蕾 杨乐 亢力 武红莉 王忠
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 天然产物 虚拟筛选
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 中药研究|Chinese Materia Medica
• 页码范围: 2596-2604
• 页数: 9页
• 分类号: R2-0
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20190605003

摘要

目的 基于分子对接技术从已经报道的具有抗菌和抑菌作用的天然产物中筛选出可能具有抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant staphy lococcus aureus,MRSA)的药物.方法 收集具有现已经报道的抗菌或者抑菌作用的天然产物859个.选择PBP2a蛋白3D结构(PDB ID:3ZG0,2.60?),应用Discovery Studio 4.5(DS 4.5)软件的CDOCKER模块进行分子对接,再以原配体打分值为参考开展系统筛选研究,最后进行了分子的ADMET分析,筛选出具有新药开发前景的化合物.结果 在PBP2a蛋白的变构位点和活性位点,打分值均高于原配体的候选化合物共计24个,其中ADMET比较好的化合物有9个.结论 本研究筛选出来的Abyssinone V、Gancaonin C、Glycycoumarin、Isogancaonin C、Kuwanon A、Lupiwighteone、Quercetin-3-methyl ether、Rhamnazin、Wighteone等9个化合物已经有抗菌或抑菌作用的报道,但是至今为止还未进行过抗MRSA方面的研究,希望本研究能够为新药研发提供参考.