观赏海棠'火焰'果皮中可变剪接基因分析

• 作者: 张杰 段诗瑶 田佶
• 来源期刊: 北京农学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 可变剪接 转录组测序技术
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 8-14
• 页数: 7页
• 分类号: S661.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2021.0102

摘要

[目的]研究观赏海棠'火焰'果皮中可变剪接基因.[方法]利用已有苹果属观赏海棠品种'火焰'果皮转录组测序数据,分析可变剪接类型和数量,并对发生可变剪接的基因进行KEGG分析,研究观赏海棠可变剪接基因与其发育过程的关系.[结果]在观赏海棠果皮发育过程中,主要发生的可变剪接是第一个外显子可变剪接和最后一个外显子可变剪接两种类型.可变剪接在果皮发育前期发生较多,同时KEGG通路分析表明可变剪接主要发生在嘌呤代谢、氧化磷酸化、糖酵解/糖异生等通路过程中.[结论]可变剪接在观赏海棠果皮的整个发育过程中普遍存在.观赏海棠果皮发育过程中共有的可变剪接基因主要与磷酸化和糖代谢有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田佶		18	95	5.0	9.0
2	张杰		25	262	7.0	16.0
3	段诗瑶		1	0	0.0	0.0