非编码RNA在脓毒症心肌细胞中表达及分析

• 作者: 黄爱蓉 梁冬施 金益梅 林苗苗 夏小娇 陈晓丽
• 来源期刊: 中华危重症医学杂志（电子版）
• 关键词: 脓毒症 肌细胞,心脏 非编码RNA
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 论著|Original Articles
• 页码范围: 113-119
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.1674-6880.2021.02.004

摘要

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)及微RNA(miRNA)在脓毒症心肌细胞中的表达情况.方法 采用基因芯片筛选对照组与脓毒症组小鼠心肌细胞中lncRNA与miRNA的差异基因,通过基因本体和京都基因与基因组百科全书对差异基因进行分析以判定差异基因主要参与的生物学功能及相关通路.通过starbase数据库及NCBI数据库中的基因数据库进一步筛选与心肌细胞及线粒体损伤相关的差异lncRNA和miRNA.采用实时定量PCR方法验证上述lncRNA与miRNA基因在脓毒症心肌细胞中的表达情况.结果 对照组与脓毒症组小鼠心肌细胞中有显著差异的lncRNA共5520个,上调的lncRNA有3186个,下调的lncRNA有2334个;有显著差异的miRNA共有90个,其中上调的miRNA共59个,下调的miRNA共有31个.生物学功能筛选发现,lncRNA中的xist、1700020I14Rik及miRNA中的miR-7a-5p、miR-30c-1-3p与心肌细胞及线粒体损害密切相关.脓毒症组细胞中xist(t=5.640,P=0.002)与1700020I14Rik(t=6.044,P=0.002)表达水平较对照组均显著升高,miR-7a-5p(t=27.277,P<0.001)与miR-30c-1-3p(t=12.910,P<0.001)表达水平较对照组均显著下降.结论 lncRNA及miRNA均参与了脓毒症心肌细胞损伤的过程,且差异基因xist、1700020I14Rik、miR-7a-5p、miR-30c-1-3p可能在其中起到关键作用.