新疆、甘肃黍稷资源的遗传多样性与群体遗传结构研究

• 作者: 薛延桃 陆平 史梦莎 孙昊月 刘敏轩 王瑞云
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 黍稷 新疆 甘肃 SSR标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1511-1521
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84174

摘要

新疆、甘肃是我国古代丝绸之路的必经之地，同时也是黍稷的主要种植区。研究该地区黍稷种质资源的遗传多样性和群体遗传结构，对于开展黍稷起源进化研究，明确黍稷传播路径具有重要的意义。本研究利用103对SSR标记对来自新疆、甘肃的216份黍稷资源进行了遗传多样性分析，共检测到299个等位基因，平均每个位点产生2.9个等位基因，平均Shannon's指数为0.7360，平均观测杂合度为0.6298，平均期望杂合度为0.5497，多态性信息含量指数为0.0688~0.7786，均值0.4714，具有中度多态性。216份黍稷资源的近交系数为0.5870，遗传分化系数为0.0383，遗传分化程度很小。甘肃资源的等位基因数、Shannon-Weaver多样性指数、Nei’s期望杂合度和PIC值分别为2.8252、0.7347、0.4501和0.4674，其遗传参数值均大于新疆资源，表明甘肃种质资源的遗传多样性较新疆更丰富。基于遗传距离的聚类分析将216份黍稷资源分为5个类群，类群I~IV共包含7份黍稷资源，与别的资源遗传关系较远;96%的资源集中于类群V，在遗传距离为0.38处，类群V又分为4个亚群，亚群A和亚群D主要包含甘肃资源，亚群B和亚群C主要包含新疆资源，表明新疆与甘肃资源有明显分离和相互渗透现象。聚类分析与群体遗传结构分析结果相似，均与生态地理分布相关。