利用生物信息学分析CALHM2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

• 作者: 刘洁 黄伟 王磊
• 来源期刊: 医学临床研究
• 关键词: 癌 非小细胞肺/遗传学 非小细胞肺/病理学
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 论著|Original Articles
• 页码范围: 179-184,188
• 页数: 7页
• 分类号: R730.26
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7171.2021.02.006

摘要

[目的]基于TCGA及GEO等数据库收录肿瘤高通量数据,分析钙稳态调节家族蛋白2(CAL-HM2)等CALHMs家族基因在非小细胞肺癌癌(NSCLC)中的表达及临床价值.[方法]利用Oncomine,GEPIA及UALCAN等在线工具分析和验证CALHMs(CALHM1-6)家族基因在NSCLC的表达水平;利用Human protein Atlas(HPA)分析CALHM2在NSCLC中的蛋白水平和定位;利用GEPIA和UALCAN分析CALHM2表达水平与NSCLC癌患者病理分期、淋巴结转移、p53突变和吸烟史的相关性;利用UALCAN分析CALHM2启动子甲基化水平;利用Kaplan-Meier Plotter分析CALHM2表达水平与NSCLC患者总生存期(OS),首次进展生存期(FP)及进展后生存期(PPS)的相关性;利用LinkedOmics分析NSCLC中与CAL-HM2表达的显著相关的基因,并利用Metascape进行GO功能富集.[结果]CALHM2在NSCLC组织中的表达水平显著下调;在NSCLC组织中CALHM2蛋白水平也显著降低.CALHM2表达水平与NSCLC患者病理分期、淋巴结转移、p53突变和吸烟史无显著相关性.Kaplan-Meier Plotter分析结果显示,CALHM2高表达的NSCLC患者的OS和FP均显著优于CALHM2低表达患者.LinckedOmics共筛查得到265个与CALHM2显著相关基因,且Metascape富集分析显示CALHM2相关基因显著富集于淋巴细胞活化和迁移,免疫激活相关过程、细胞因子释放调控等过程.[结论]在NSCLC中CALHM2表达显著下调,其可作为NSCLC患者预后的判断标志物.