OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析

• 作者: 周丹菲 张玉萍 张秋红 明宗娟 李维 杨拴盈 程西安
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鸟氨酸氨基转移酶 肺肿瘤 表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 521-530
• 分类号: R734.2
• 字数: 5748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2012.09.04

摘要

背景与目的 已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶( ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌( non-small cell lung cancer,NSCLC) 中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析.方法 通过RT-PCR的方法比较A549和16HBE细胞间OAT mRNA水平的差异;采用免疫组织化学SP法检测55例肺癌组织和17例癌旁肺组织中OAT蛋白表达;利用生物信息学的方法对OAT蛋白的生物信息学特征和相互作用蛋白进行分析,并对筛选出来的相互作用蛋白进行GO注释和信号通路分析.结果 ①A549中OAT mRNA相对含量较16HBE中低,两者差异约2.85倍.②NSCLC中OAT蛋白的表达明显高于癌旁肺组织(P＜0.05);OAT蛋白在鳞癌和腺癌间的表达差异有统计学意义,而与患者性别、年龄、有无淋巴结转移、肿瘤直径及TNM分期无关.③生物信息学分析提示OAT蛋白定位于线粒体、为高度保守的亲水性蛋白,具有Aminotran-3结构域,可能存在多个丝/苏氨酸磷酸化位点,在信号转导、转录和分子转运等方面发挥一定的作用;在筛选出来的54种可能和OAT存在相互作用的蛋白质中,TNF和TRAF6这两种蛋白参与了NF-κB信号通路.结论 OAT可能在NSCLC的发生和发展中发挥重要作用,有望成为肺癌的早期诊断标志物和治疗的新靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李维	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	56	322	9.0	14.0
2	杨拴盈	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	72	472	10.0	19.0
3	张秋红	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	15	59	5.0	7.0
4	张玉萍	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	7	24	4.0	4.0
5	程西安		6	25	4.0	5.0
6	明宗娟	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	15	35	4.0	5.0
7	周丹菲	西安交通大学附属第二医院呼吸内科	2	11	2.0	2.0