枯草芽孢杆菌JLGA-SD-28转化人参皂苷Rb1的特性及其全基因组测序分析

• 作者: 赵彩秀 王楠 黄鑫 越皓 郭云龙 刘淑莹
• 来源期刊: 中成药
• 学科: 医学
• 关键词: .微生物转化 土壤 稀有人参皂苷 高分辨质谱 全基因组测序
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 科研报道
• 页码范围: 518-523
• 页数: 6页
• 分类号: R282
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1528.2021.02.045

摘要

目的 对枯草芽孢杆菌JLGA-SD-28转化人参皂苷Rb1的特性及其全基因组测序进行分析.方法 利用ONT测序平台以及Nanopore测序平台进行全基因组测序鉴定该菌的特征,并对该菌进行了GO、COG以及CAZy功能注释分析.结果 该菌株基因组全长为4 215 536 bp,GC含量为43.51％,预测编码了4 229个开放阅读框(ORFs);GO分析的功能细分为43类,COG分析的功能细分为25类,CAZy分析该菌有108个与人参皂苷转化相关的基因.结论 枯草芽孢杆菌JLGA-SD-28全基因组测序结果可为今后进一步研究该菌种对人参皂苷的转化提供依据.