暗纹东方鲀leptin基因的克隆、SNP筛选及其与生长性状的关联分析

• 作者: 余云登 朱浩拥 王盛南 王耀辉 马文超 杨晓 朱永祥 钱晓明 王秀利
• 来源期刊: 大连海洋大学学报
• 关键词: 暗纹东方鲀 瘦素基因 基因克隆 SNP 生长性状 关联分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Articles
• 页码范围: 207-213
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2020-287

摘要

为明确暗纹东方鲀Takifugu obscurus瘦素(Leptin)基因的基本性质,并探究leptin基因的多态性及其与暗纹东方鲀生长的相关性,随机选择6尾健康的3月龄暗纹东方鲀幼鱼作为基因克隆的试验样本,采用RT-PCR方法克隆leptin基因的cDNA序列,随机选择同期繁殖、同塘养殖的178尾8月龄鱼,采用直接测序法筛选leptin基因中与生长相关的SNP位点.结果表明:克隆得到的leptin cDNA序列长为661 bp,包括459 bp的开放阅读框,共编码152个氨基酸,Leptin氨基酸序列含19个氨基酸的信号肽序列,推测该蛋白为亲水的稳定蛋白;暗纹东方鲀Leptin氨基酸序列与红鳍东方鲀Leptin氨基酸序列一致性最高,为96.7％,与不同种属的其他鱼类相似性较低,与草鱼氨基酸序列的一致性仅为25.25％,但不同物种的Lep-tin存在较高的三级结构相似性;在暗纹东方鲀leptin基因上筛选得到2个分型稳定的SNP位点(T24G、T193A),其中,T24G位点不同基因型个体间的体质量存在显著性差异(P<0.05),GG基因型个体体质量显著小于TG和TT基因型(P<0.05);将2个SNP位点的不同基因型进行组合,经关联分析获得优势双倍型D5,D5型个体的3个生长性状值最高,体质量显著高于D2、D4型个体(P<0.05),极显著高于D6型个体(P<0.01),体长和体全长显著高于D6型个体(P<0.05).研究表明,T24G位点的TG和TT基因型及双倍型D5是暗纹东方鲀优势生长的基因型,可作为暗纹东方鲀辅助育种的候选分子标记.