马铃薯近缘种Solanum etuberosum的耐盐性鉴定及相关基因的表达分析

• 作者: 曾祥至 赵俊超 祝光涛
• 来源期刊: 云南师范大学学报（自然科学版）
• 关键词: 盐胁迫 转录组 差异表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 马铃薯研究
• 页码范围: 18-24
• 页数: 7页
• 分类号: S532|Q945.78
• 语种: 中文
• DOI: 10.7699/j.ynnu.ns-2021-042

摘要

以Solanum etuberosum(etb)和栽培马铃薯为材料,利用200 mmol/L NaCl溶液进行处理,发现etb与栽培马铃薯比较,耐盐性较强.并进一步检测了盐处理条件下etb的鲜重、叶片萎蔫度、相对电导率和叶绿素含量.对植株在0、6、12 h和24 h处理后进行转录组数据分析,发现与0 h比较,etb中共有3 587个基因表达上调,4 311个基因表达下调,其中3个时间点共有的差异表达基因为1 250个,差异表达基因主要富集在代谢途径以及次生代谢生物合成通路.通过Blast比对已知功能的基因,鉴定出了36个持续响应盐胁迫的差异表达基因,其中6个基因来自2C类蛋白磷酸酶(PP2C)家族,21个基因来自类钙调蛋白(CML)家族;还包括离子转运体阳离子质子交换蛋白(CHX20)、钾离子反向转运蛋白(KEA3)、钾离子转运蛋白(KT17)、离子通道钾离子四聚体通道蛋白(KCTD)、慢阴离子通道蛋白(SLAC1)、b型氯离子通道(CLC-b)和c型氯离子通道(CLC-c).对这些基因的表达量进行分析,发现大部分基因在盐胁迫下表达量持续降低,暗示其可能通过负调控参与响应盐胁迫.