右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B) 34991的全基因组分析

• 作者: 王珊珊 石继春 杜宗利 石刚 龙新星 叶强 徐颖华
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 关键词: 右旋糖酐 肠膜状明串珠菌 生产用菌种 全基因组序列 质量控制
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 666-670,677
• 页数: 6页
• 分类号: R186
• 语种: 中文

摘要

目的 对我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B) 34991的全基因组分子特征进行分析.方法 将CMCC(B) 34991菌种培养后,依次进行形态观察、生化鉴定、质谱分析及16S rRNA序列测定,同时应用高通量测序技术,对CMCC(B) 34991菌种进行全基因组序列测定和比较基因组学分析.结果 CMCC(B) 34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株的16S rRNA基因序列相似度均大于99.5％.CMCC(B) 34991菌种染色体全基因组序列全长为1857684 bp,平均GC含量为38.2％,共含有2089个基因,编码基因占整个基因组序列的88.4％,其中具有直系同源簇(clusters of orthologous groups,COG)功能1621个,参与KEGG代谢通路1112个.CMCC(B) 34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株之间核苷酸同源性很高,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)值大于98.5％,DNA-DNA杂交(DDH)值超过89％,它们之间的共有基因1186个,而CMCC(B) 34991菌种基因组特有基因247个.进化树显示,肠膜状明串珠菌与其他明串珠菌的分子进化历程不同.结论 首次获得了我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B) 34991全基因组的基本特征,为后续右旋糖酐的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础.