烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析

• 作者: 陈邦兰 翟梦倩 龙涛 赵顺程 刘娟 尹茂灵 万心言 王治杰 刘继恺
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 自然抗性相关巨噬细胞蛋白 烟草 基因家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 100-104,109
• 页数: 6页
• 分类号: S572
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2021.03.027

摘要

自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用.为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析.结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1～6.2,其编码氨基酸长度为500～542 aa,蛋白分子量为54.31～59.11 kD,等电点为5.09～8.73,总平均亲水性为0.475～0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1～motif10.顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件.染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上.表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性.该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础.