基于加权基因共表达网络分析挖掘脑胶质瘤预后标志

• 作者: 张春雨 叶立果 王龙 谈胤求 袁凡恩 陶野 陈谦学 田道锋
• 来源期刊: 中国医师杂志
• 关键词: 胶质瘤 预后 基因表达谱 基因调控网络
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 529-533
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn431274-20200107-00018

摘要

目的:为胶质瘤患者识别有效的生物标志物。方法:从中国脑胶质瘤基因计划谱(CGGA)下载附有完整临床随访信息的464例胶质瘤患者mRNA表达谱。加权基因共表达网络分析(WGCNA)用于识别出与胶质瘤WHO分级相关的基因模块，并同时进行单因素及多因素Cox回归分析鉴别出与胶质瘤患者生存相关的基因。结果:在加权基因共表达分析中，Brown模块与脑胶质瘤WHO分级呈正相关( r＝0.55， P<0.01)。选择单因素分析中与患者临床预后最显著相关的5个基因(TAGLN2，IGFBP2，METTL7B，ARAP3，PLAT)进行多因素生存分析并建立预后模型，计算风险评分。受试者工作特征曲线证实该风险评分在预测胶质瘤患者1、3、5年生存率上具有高精准度。上述生存分析结果均在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中得到验证。 结论:本研究确定了五个独立的脑胶质瘤预后因素(TAGLN2，IGFBP2，METTL7B，ARAP3及PLAT)并建立了预后模型，为临床判断胶质瘤患者预后提供新的思路。