编码酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因克隆及其生物信息学分析

• 作者: 王长丽 廖巍 叶广彬 葛菁萍 刘磊 马毓坚 黄霞 宾晓芸
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 酿酒酵母 生物信息学分析 克隆 丙酮酸脱羧酶基因 开放阅读框
• 年，卷（期）: 2021,（9）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 103-108
• 页数: 6页
• 分类号: S216.2
• 语种: 中文

摘要

旨在从生物信息学角度更好地研究酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)的结构和功能,克隆酿酒酵母H5的丙酮酸脱羧酶基因pdc6.利用Primer 5.0软件设计1对20 bp引物,以H5基因组DNA为模板克隆获得pdc6,并利用生物信息学分析方法对其序列进行验证及分析.该序列长度为1692 bp,无碱基缺失,且该基因具有完整的开放阅读框,该基因编码的Pdc6包含563个氨基酸残基,该蛋白质中酸性氨基酸残基数量和碱性氨基酸残基数量大致相同;Pdc6理论等电点5.8,疏水性最大值为2.32,亚细胞定位预测其位于细胞外基质,属于酸性蛋白质,并预测了空间结构模型.本研究说明该蛋白结构与Pdc1和Pdc5结构类似,对酿酒酵母H5编码丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因序列克隆和生物信息学分析后,可为后续单基因敲除选取基因顺序的研究提供一定的理论基础.