早发型及晚发型子痫前期miRNA调控网络的构建及生物信息学分析

• 作者: 徐其艳 齐成秋 王李纲 蒋瑗瑗 高迎春 董小菡
• 来源期刊: 中国优生与遗传杂志
• 关键词: 早发型子痫前期 晚发型子痫前期 微RNA 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1532-1537
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

目的 对早发型子痫前期(EOPE)及晚发型子痫前期(LOPE)胎盘差异表达微RNA(miRNA)进行生物信息学分析,并构建miRNA调控网络,为后续的机制研究提供理论基础及新思路.方法 在数据库GEO中选择早发型子痫前期及晚发型子痫前期胎盘组织miRNA差异表达数据集GSE103542,选取其交集miRNA及各自表达显著的miRNA作为研究对象,应用miRDB、TargetScan及miRTarBase软件预测靶基因.对其进行生物信息学分析,并利用STRING网站构建上调及下调miRNA调控网络.结果 早发型子痫前期及晚发型子痫前期各筛选出34个差异表达miRNA,其中交集miRNA 3个,早发型子痫前期组显著表达miRNA 4个,晚发型子痫前期组显著表达miRNA 7个.交集miRNA靶基因的信号通路分析显示其靶基因在cAMP信号通路及Wnt信号通路等信号通路中显著富集;对早发型子痫前期组在PI3K-Akt信号通路中富集程度最高;晚发型子痫前期组在FoxO信号通路中显著富集.下调miRNA调控网络中3个交集miRNA均处于调控网络的中心位置,且以miR-383为核心,其核心基因为CDC27、KBTBDB 及HDAC2.上调miRNA调控网络中miR-let-7c处于调控网络的中心位置,其核心基因为CCND1及CCNB2.结论 筛选出的miRNA及核心基因可能与子痫前期的发生发展相关,其在子痫前期中的作用机制有待进一步验证.