结肠腺癌免疫预后基因的开发与验证

• 作者: 向瑶 周伟弘 王桃丽 王俊普
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠腺癌 免疫预后基因 风险评分
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 163-169,170
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13267/j.cnki.syzlzz.2022.026

摘要

目的 发掘结肠腺癌（colon adenocarcinoma，COAD）免疫预后标志物并精准预测 COAD 生存风险。方法 从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库下载 COAD 患者的临床信息以及 RNA-seq 数据，获取差异的免疫相关基因（differential immune related gene，DEIRG）。利用单变量和多变量 Cox 比例风险回归模型鉴定具有预后价值的免疫基因构建模型。利用 Kaplan-Meier 法分析模型中高风险和低风险患者的生存状态，并使用受试者操作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线评估该风险评分模型的准确度，并且从样本中随机抽取 70% 的病例作内部验证。采用单因素和多因素 Cox 回归分析，确定 COAD 的独立预后因素。结果 利用单因素和多因素 Cox 比例风险回归分析确定载脂蛋白 12（lipocalin 12，LCN12）、嗜铬素 A（chromogranin A，CHGA）、抑制素 β 亚基（inhibin subunit beta B，INHBB）、R3H 域包含像（R3H domain containing like，R3HDML）和黑皮质素 1 受体（melanocortin 1 receptor，MC1R）为 COAD 患者预后风险模型中的 5 个风险基因（均P<0.05），对该模型进行风险评分，高风险组患者总生存时间较低风险组短（P=0.007），在随机抽取的内部测试组中得到验证，高风险组患者预后较低风险组差（P=0.028）。风险评分预测 1 年和 3 年总生存的 ROC 曲线下面积（area under curve，AUC）为 0.715 和 0.683，内部验证组 ROC AUC 分别为 0.736 和 0.673。单因素和多因素 Cox 分析显示，在实验组及内部验证组中风险评分是 COAD 的独立预后因素（P<0.01）。结论 开发并验证的 COAD 免疫预后基因 LCN12、CHGA、INHBB、R3HDML 和 MC1R 可提高 COAD 筛查及诊断效率，并对鉴定高或低生存风险的 COAD 患者亚组的治疗具有意义。