粪便样本中高纯度人源DNA富集提取方法

• 作者: 吴帅帅 武云晖
• 学科: 化学
• 关键词: 人源DNA富集 粪便DNA提取 SFRP2基因甲基化 结直肠癌筛查
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 29-33
• 页数: 4页
• 分类号: R446.13
• 语种: 中文

摘要

粪便肠脱落细胞DNA的提取是影响基因检测技术在结直肠癌筛查领域应用的关键。目的：通过对提取过程、试剂进行研究，开发高纯度人源DNA富集提取方法。方法：对粪便样本提取前均质化方式进行优化，并使用PVP高分子交联剂预处理均质化粪便上清。结果：颠倒混匀均质化方式可以显著降低微生物DNA的比例，实现人源DNA的相对富集；PVP高分子交联剂可以有效去除多糖、蛋白、胆盐等杂质，减少粪便DNA的PCR抑制；结直肠癌患者粪便DNA与癌组织样本DNA的重亚硫酸盐转化测序（BSP）结果中的甲基化特征一致。结论：优化后的粪便DNA富集提取产物PCR检测结果准确性良好，该提取方法可行性高。