DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性

• 作者: 王开杰 徐永江 柳学周 崔爱君 姜燕 王滨 方璐
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鰤属鱼类 DNA条形码 遗传距离 系统进化树
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 171-183
• 页数: 13页
• 分类号: S961
• 语种: 中文
• DOI: 10.12264/JFSC2021-0295

摘要

为了探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ、Ⅱ(COⅠ、COⅡ)和16SrRNA基因在鰤属鱼类物种鉴定和群体划分中的适用性,在黄条鰤(Seriola lalandi)、高体鰤(Seriola dumerili)、五条鰤(Seriola quinqueradiata)等鰤属鱼类中克隆了 3种基因,并进行序列比对与系统进化分析.结果显示,COⅠ、COⅡ和16SrRNA的基因序列均表现出明显的A+T偏倚性;16S rRNA序列最为保守,变异率仅为5.06％;CO Ⅰ序列的平均核苷酸差异数(k)和核酸多样性指数(Pi)高于CO Ⅱ和16S rRNA,CO Ⅱ的单倍型多样性指数最高,CO Ⅰ序列分化程度更高.比较了鰤属鱼类3种基因的扩增序列,发现COⅠ、CO Ⅱ和16S rRNA均能对我国分布的3种鰤属鱼类进行有效鉴别.另外,COⅠ、COⅡ还可作为不同地理群体黄条鰤的鉴别DNA条形码,而16S rRNA对于不同地理群体的黄条鰤辨识能力不足.在鰤属鱼类中,基于COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因计算的种间遗传距离都大于种内遗传距离的10倍以上,系统进化分析显示每个物种都形成单系,表明COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因不仅可作为鰤属鱼类物种鉴定和多样性保护的有效DNA条形码,CO Ⅰ、CO Ⅱ还可作为黄条鰤不同地理种群划分和国际资源判别的依据.