基于生物信息学分析筛选宫颈癌进展中的关键基因

• 作者: 刘玉林 臧玉琴 王颖梅 薛凤霞
• 来源期刊: 天津医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 宫颈癌 生物信息学分析 差异表达基因 差异表达miRNA 蛋白质-蛋白质相互作用网络 miRNA-靶基因调控网络
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生物信息学专题
• 页码范围: 8-14
• 页数: 7页
• 分类号: R737.33
• 语种: 中文

摘要

目的:通过生物信息学分析的方法,筛选宫颈癌进展中的关键基因,寻找潜在的分子标志物和治疗靶点.方法:在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中检索宫颈癌进展相关的mRNA和miRNA基因芯片数据,借助GEO2R分析差异表达基因(DEG)和差异表达miRNA(DEM),进行富集分析以及构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和miRNA-靶基因调控网络.结果:共筛选出250个DEG和166个DEM,并构建出由123个节点(node)和283项互相作用(edge)构成的PPI网络以及由66个节点和137个相互作用构成的miRNA-靶基因调控网络.经分析,ATAD2、SMC4和POLQ基因不仅是筛选出的表达上调的DEG,而且是PPI网络中枢纽蛋白的编码基因,并在miRNA-靶基因调控网络中同时受DEM—miR-20A、miR-20B、miR-106B和miR-17-5P的调控.结论:ATAD2、SMC4和POLQ基因可能在宫颈癌进展过程中发挥着重要作用.