广西部分猪场猪流行性腹泻病毒S基因克隆及序列分析

• 作者: 李春英 何奇松 冯淑萍 杨可妍 曾咏芳 熊毅 颜健华
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2022.02.004

摘要

采集广西25个猪场的病料,对猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性组织样品进行全S基因扩增.将41株全S基因进行序列比对及遗传进化分析,41株PEDV的S基因之间核苷酸同源性为94.8％～100％,与参考毒株核苷酸同源性为89.3％～99.4％.S基因进化树图谱显示,广西当前流行的PEDV可分为2个谱系.Attenuated-DR13、CV777和该研究中的 CHGXLC055-92013、CHGXLC055-52013、CHGXGP035-72013和 CHGXGP035-82013为 Cluster1;Cluster3包括该研究另外37株毒株、韩国株 Spk1、HuN和日本株NK等参考毒株.表明广西大部分毒株S基因与欧洲株CV777、LZC等国内早期毒株存在较大的差异,进化树亲缘关系比较远;在抗原表位区域存在较大变异,当前的CV777疫苗株在防控PEDV入侵时可能不会产生良好的免疫保护效果.