基于SLAF的甜瓜SNP遗传连锁图谱构建和种子性状QTL定位

• 作者: 李俊凤 王岭 戴冬洋 才羿 杨丽敏 王超 盛云燕 田丽美
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 特异性位点扩增片段(SLAF)遗传图谱 种子相关性状 QTL
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告|Articles and Letters
• 页码范围: 656-666
• 页数: 11页
• 分类号: S652
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.004

摘要

种子相关性状是作物重要的农艺性状,对甜瓜(Cucumis melo)遗传育种及其相关分子生物学研究具有重要意义.本研究选择薄皮甜瓜小粒种子品系'P5'为母本、厚皮甜瓜大粒种子品系'P10'为父本,配置杂交组合,获得F1、F2群体,利用450个F2单株开展种子相关性状遗传分析,结果显示,种子形状和种皮颜色符合3:1的分离比例(χ2=0.26和0.07),两者均为1对等位基因控制的质量性状;种子长度、种子宽度和种子百粒重均呈单峰正态分布,为典型的数量性状.利用127个F2单株开展特异性位点扩增片段测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)并构建高饱和甜瓜遗传图谱,对种子相关性状开展QTL初步分析.构建的甜瓜遗传图谱包含12个连锁群,获得了3716个上图标记,总图距为1356.49 cM,标记间平均遗传距离为0.37 cM;将控制甜瓜种子形状(seed shape,SS)的位点SS3.1定位在甜瓜3号染色体31470843～31659961 bp,表型贡献率为26.45％;将控制甜瓜种皮颜色(seed color,SC)的位点SC12.1定位在甜瓜12号染色体12785226～15029452 bp,表型贡献率为14.07％;检测到控制甜瓜种子百粒重(hundred of seed weight,HSW)的2个QTL位点(HSW6.1和HSW7.1),HSW6.1位于甜瓜6号染色体1082887～1206028 bp,表型贡献率为13.97％,HSW7.1位于甜瓜7号染色体458518～1212963 bp,表型贡献率为9.76％;检测到1个控制甜瓜种子长度(seed length,SL)的QTL位点(SL3.1),位于甜瓜3号染色体31430517～31553644 bp,表型贡献率为27.43％;检测到2个控制甜瓜种子宽度(seed width,SW)的QTL位点(SW3.1和SW12.1),SW3.1位于甜瓜3号染色体31447562～31470545 bp,表型贡献率为16.03％,SW12.1位于甜瓜12号染色体1254239～1313909 bp,表型贡献率为12.88％.研究结果为进一步克隆甜瓜种子相关性状的基因挖掘与功能分析提供理论依据.