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毛白杨PtYABBY基因家族3个成员的克隆与表达分析
毛白杨PtYABBY基因家族3个成员的克隆与表达分析
作者:
郝颖颖
周明珠
韩开元
杨雄
高钰涵
陈仲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
毛白杨
YABBY
克隆
表达模式
雌雄花芽
摘要:
[目的]YABBY是高等植物中特有的转录因子家族,在侧生器官发育和开花过程中发挥重要作用.本研究对毛白杨PtYABBY基因进行克隆和生物信息学分析,并对雌雄花芽8个关键发育时期和根茎叶等组织中PtYABBY基因表达模式进行探究,以期为阐明PtYABBY基因在毛白杨侧生器官发育过程中的功能奠定前期基础.[方法]以毛白杨为试材,采用同源基因克隆法从毛白杨中分离FILAMENTOUS FLOWER (FIL)/YABBY3 (YAB3)同源基因PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11的编码区序列,并开展生物信息学分析.通过qRT-PCR研究这3个基因在雌雄花芽8个发育时期及根、茎、幼叶、成熟叶片中的表达规律.[结果]PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11编码区长度分别为633、642、639 bp,分别编码210、213、212个氨基酸.所推测的氨基酸序列包含C2C2锌指结构域和YABBY结构域.系统进化分析进一步表明这3个基因属于FIL/YAB3亚家族成员.qRT-PCR结果显示这3个基因在根、茎、叶及8个时期雌雄花芽组织中均有表达,但PtYABBY基因间的表达水平存在明显差异.PtYABBY3表达水平在雌雄花芽发育初期下调,发育后期上调;花原基形成到休眠期内PtYABBY3在雌雄花芽中呈现相反的表达变化趋势.PtYABBY4和PtYABBY11基因在雌雄株成花诱导期表达水平最高,成花诱导到伸长期内呈现下降趋势,在雄花芽休眠期和小孢子发生期基因表达水平无明显变化.营养组织表达量测定结果显示这3个基因在幼叶和成熟叶片中表达水平相对较高,根系中表达量最低.[结论]YABBY基因家族成员PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11同属FIL/YAB3亚类,在毛白杨雌雄花芽发育的8个时期中表达水平存在较大差异,且在叶片和花芽中表达量较高,表明其可能与叶片和花芽发育相关.本研究为今后深入研究YABBY家族成员在杨树器官生长发育过程中的作用奠定基础.
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内容分析
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相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
毛白杨PtYABBY基因家族3个成员的克隆与表达分析
来源期刊
北京林业大学学报
学科
农学
关键词
毛白杨
YABBY
克隆
表达模式
雌雄花芽
年,卷(期)
2022,(1)
所属期刊栏目
林学|Forest Sciences
研究方向
页码范围
48-57
页数
10页
分类号
S792.117
字数
语种
中文
DOI
10.12171/j.1000−1522.20210277
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
毛白杨
YABBY
克隆
表达模式
雌雄花芽
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
北京林业大学学报
主办单位:
北京林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-1522
CN:
11-1932/S
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区清华东路35号
邮发代号:
18-91
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3848
总下载数(次)
8
总被引数(次)
70613
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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