基于细胞色素P450通路的前列腺癌差异关键基因的筛选与验证

• 作者: 黄可馨 罗丹 王慧丰 魏银锋 华毅明 谢博 罗海琼 陈庆锋
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 前列腺癌 差异表达基因 细胞色素P450
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 42-48
• 页数: 7页
• 分类号: R737.25
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2022.01.007

摘要

目的:研究细胞色素P450与前列腺癌的相关性,通过生物信息挖掘发现细胞色素P450通路与前列腺癌发生发展相关的重要节点.方法:基于3套(GSE46602、GSE32571、GSE70768)前列腺癌数据集筛选差异表达基因,比较关键基因在前列腺癌和正常组织的差异,再结合蛋白表达及病理评分筛选出与前列腺癌发生发展相关联的3个关键节点,并用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)进行实验验证.结果:3套全基因组表达谱整合分析找到P450相关的通路存在ALDH3B2、GSTP1、CYP3A5、GSTM1、GSTM5、GSTM2、MGST3等7个差异表达基因(P＜0.05,LogFC＜-0.5或LogFC＞0.5).结果发现不同Gleason分级仅与其中的6个基因的mRNA表达有相关性(P＜0.05).蛋白表达分析结果显示GSTP1、GSTM1、GSTM5这3个基因的前列腺癌和癌旁组织的蛋白表达差异具有统计学意义(P＜0.05).RT-qPCR验证发现,与前列腺癌旁正常细胞RWPE-1相比,GSTM1和GSTP1在不同的前列腺癌细胞(DU145、C4-2、LNCaP)中mRNA表达下降.GSTM5表达虽然明显降低但差异无统计学意义(P＞0.05).结论:通过多套数据在mRNA和蛋白质表达水平上整合分析发现,P450相关的药物代谢—细胞色素P450通路和细胞色素P450对外来异物的代谢通路与前列腺癌的发生发展存在紧密相关.