利用转录组测序生物信息学初步探讨热射病预后关键基因

• 作者: 张玲琴 谢建刚 王倩梅 徐云云 黄杨
• 来源期刊: 中国急救医学
• 关键词: 转录组测序 热射病预后 趋化因子(C-C基元)配体5(CCL5)
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 64-67
• 页数: 4页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-1949.2022.01.013

摘要

目的 分析热射病患者外周血单个核细胞转录组测序生物信息学结果,寻找影响热射病预后的关键基因.方法 选取2019-06-01～2020-08-30空军军医大学附属西京医院急诊科收治的热射病患者,按照预后分为生存组和死亡组.随机数字法在两组中分别选取患者进行外周血单个核细胞转录组测序,生物信息学分析寻找差异基因;RT-PCR验证筛选出的差异基因在生存组和死亡组中的表达.结果 29例诊断为热射病患者入选,按照预后分为生存组和死亡组,其中生存组18例,死亡组11例.随机数字法选取6例生存患者和4例死亡患者,外周血单个核细胞进行转录组测序,两组患者有693个基因表达有明显差异,通过生物信息学分析筛选出趋化因子(C-C基元)配体5(CCL5)、基质金属蛋白酶8(MMP8)、MMP9基因可能与预后相关.将两组外周血单个核细胞的目标基因表达情况通过RT-PCR法表达检测,与生存组比较,死亡组MMP8基因(P=0.8955)和MMP9基因(P=0.0597)表达无明显变化,CCL5基因表达明显上升(t=7.056,P<0.05).结论 CCL5基因可能是影响热射病预后的关键基因,需要进一步深入研究.