基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

• 作者: 木云珍 杨家甜 熊庆 蒋国庆 马国玉
• 来源期刊: 昆明医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 肺腺癌 基因 生存分析 预后
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 页码范围: 30-37
• 页数: 8页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3436字
• 语种: 中文

摘要

目的 利用生物信息学方法筛查肺腺癌的差异基因,分析其在肺腺癌的发生发展过程中可能参与的信号传导通路,寻找肺腺癌的关键基因并评估其对肺腺癌预后的意义.方法 从GEO数据库中获取肺腺癌基因表达芯片数据集GSE10072、GSE32863、GSE43458和GSE116959,将四组数据集整合后获得肺腺癌的差异表达基因,采用STRING数据库对差异表达基因构建肺腺癌蛋白-蛋白互相作用网络,通过在线网站DAVID对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,用Cytohubba筛选关键基因,并利用GEPIA分析关键基因与预后的相关性.结果 初步筛查得到214个差异基因,包括42个上调基因和172个下调基因,最后筛选得到6个关键基因.生存分析显示PECAM1、SPP1和KIAA0101的表达对肺腺癌的预后有显著影响(P<0.05),Diseasemeth分析显示SPP1、KIAA0101、COL3A1、GNG11和FOS基因在肺腺癌组织中的甲基化水平异常(P<0.05).结论 这6个基因可能参与了肺腺癌的发生发展,对肺腺癌的诊断、靶点治疗和预后提供一定参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马国玉	昆明医科大学公共卫生学院	8	6	2.0	2.0
2	杨家甜	昆明医科大学公共卫生学院	7	3	1.0	1.0
3	木云珍	昆明医科大学公共卫生学院	17	25	2.0	4.0
4	熊庆	云南省疾病预防控制中心环境卫生所	11	23	2.0	4.0
5	蒋国庆	昆明医科大学第一附属医院产科	4	3	1.0	1.0