基于生物信息学构建卵巢浆液性腺癌预后风险模型及潜在中药预测分析

• 作者: 盛超 金芳和
• 来源期刊: 中医药临床杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢浆液性腺癌 风险评分 预后模型 中医药
• 年，卷（期）: 2023,（7）
• 所属期刊栏目: 数据分析
• 页码范围: 1252-1259
• 页数: 7页
• 分类号: R271.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16448/j.cjtcm.2022.0717

摘要

目的：构建卵巢浆液性腺癌（Ovarian serous cystadenocarcinoma，OV）预后风险模型，针对核心预后基因筛选潜在中药。方法：数据来源于TCGA数据库，采用差异分析与单因素 Cox 回归筛选OV差异预后基因；以 Kaplan-Meier（KM）曲线P<0.05，且受试者工作特征曲线（Receiver Operating Characteristic curve，ROC），以AUC>0.7为筛选条件，进一步聚焦到OV核心差异预后基因；采用单因素、多因素Cox回归构建卵巢浆液性腺癌核心差异预后基因风险评分系统，并结合临床信息开发临床预测模型，对预测模型进行Calibration分析与DCA分析。通过CIBERSORT反卷积法分析24类免疫细胞在OV中的含量及比例。通过Coremine、TCMSP、TCMIP数据库预测OV差异核心预后基因的潜在中药。结果：TCGA数据库获得346个DEGs、14个OV差异预后基因、7个OV核心差异预后基因达。非配对t检验显示FGF20、TRPM3、KLK3在卵巢浆液性腺癌中低表达，SAA2-SAA4、ADGRG5、EPB41L1、DAP1在卵巢浆液性腺癌中高表达。7个核心差异预后基因多因素Cox回归分析发现，SAA2-SAA4、ADGRG5、TRPM3、DAPL1（P<0.05）均可作为OV的独立预后基因。7个核心差异预后基因构建的风险评分系统能显著区分生存，低风险评分具有的生存预后，是卵巢浆液性腺癌的危险因素，time-ROC提示风险评分能较好的评估生存预后，且5年的预测能力最佳。临床预测模型诺莫图可有效预测1年、3年、5年的生存概率。免疫浸润结果构建了与24种免疫细胞的相关性。coremine数据库预测出三七叶、三七花、地榆等18个OV差异核心预后基因的潜在中药，药物多归肝经，功效多与补虚止血有关。结论：本研究筛选出OV核心差异预后基因，构建了OV预后风险评分系统，并开发了临床预后模型诺莫图，同时对OV核心差异预后基因进行了免疫浸润分析，预测了治疗OV的潜在中药，为中医药干预卵巢癌提供了新思路。