基于MSAP技术的不同栽培生产区域宁夏枸杞DNA甲基化多态性分析

• 作者: 张芳 卢有媛 尚尔鑫 郭盛 鲁学军 任钢 陈占平 赵玉玲 钱大玮 段金廒
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 关键词: 宁夏枸杞 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 表观遗传 生态因子
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 分子生药学
• 页码范围: 392-402
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20211023.102

摘要

宁夏枸杞在我国不同栽培产区环境中,发生了明显的表观遗传变异和分化.为探讨我国不同栽培产区宁夏枸杞DNA甲基化水平和模式的差异及变化规律,该文利用荧光标记辅助的甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术,对我国主要栽培产区宁夏银川平原、内蒙古巴彦淖尔、甘肃靖远、甘肃玉门、青海德令哈、新疆精河的53份宁夏枸杞基因组DNA样品进行甲基化水平和多态性分析.该研究建立了适用于宁夏枸杞基因组甲基化分析的MSAP技术体系,共筛选出10对MSAP选择性扩增引物,在所有共扩增出的5'-CCGG-3'甲基化位点中,35.85％为全甲基化位点、39.88％为半甲基化位点,表现出丰富的表观遗传分化程度.化学计量分析显示,影响宁夏枸杞表观遗传特性的主要因素是生态环境因素,其次是栽培品种差异因素,降水量、气温、土壤酸碱度等是影响各产地DNA甲基化差异的主要生态因子.该研究有助于深入理解宁夏枸杞在不同生态环境的适应策略,为枸杞子的种质溯源和道地性评判提供新的研究思路与方法.